最早的HIV-1人类感染是从1959年刚果民主共和国一位男性的血液样本中发现。（他如何被感染仍然未知）对血液样本的基因分析显示HIV-1可能起源于1940后期到1950早期的某种单个病毒。
我们知道HIV病毒至少从1970中晚期开始就在美国存在。1979-1981间有医生报道在洛杉矶和纽约的不少男性同性恋者中发现罕见的肺炎，癌症和其他疾病。这些疾病并不存在于免疫系统正常的人群中。
1982年时医学界开始用acquired immunodeficiency syndrome (获得性免疫缺陷综合症）或AIDS来描述这些原先健康的人发生的机会性感染，Kaposi肉瘤，卡氏肺囊虫肺炎。美国对AIDS正式的追踪也从那时开始。
在1983年，科学家发现了引起AIDS的病毒。病毒起先被命名为HTLV-III/LAV (human T-cell lymphotropic virus-type III/lymphadenopathy- associated virus). 后来改名为HIV (human immunodeficiency virus).
很多年来科学家们试图寻找HIV的起源以及是如何传播给人类的。大多数人相信HIV起源于其他灵长类动物。在1999年，一个国际研究小组报道他们发现了HIV-1（在发达国家里HIV的主要的一株）的起源，一种非洲西部的猩猩被确定为病毒的来源。研究人员们相信HIV-1在猎人暴露于被感染的血液时传播给人类
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